Помимо общего количества тарелок: метагеномные применения для переработчиков мяса и птицы

Видео предоставлено: mladenbalinovac/Creatas Video через Getty Images

Сегодняшний коммерческий завод по переработке мяса или птицы представляет собой сложную сеть оборудования, автоматизации, человеческого взаимодействия и множества процессов/путей. Эти компоненты работают вместе, чтобы эффективно изготовить тушу на несколько основных, субпервичных и обрезков, которые будут использоваться для дальнейшей обработки. Здесь их можно либо упаковать в сыром виде, либо подвергнуть дальнейшей переработке в готовые к употреблению мясные изделия (RTE). По своей сути этот рабочий процесс на протяжении тысячелетий был успешным, поскольку позволял создавать самые разнообразные отдельные куски мяса и мясные изделия, подвергшиеся дальнейшей обработке, такие как колбаса, о которой было сказано еще в «Одиссее» Гомера, написанной примерно 10 000 лет назад. .

Несмотря на то, что процессы изменились и были внедрены передовые технологии, одной из констант на протяжении всей эволюции мясной промышленности был вклад очень биологически разнообразного микробиома. Этот микробиом может содержать тысячи различных видов бактерий, вирусов и грибов, живущих вместе как сообщество и населяющих животных, технологическую среду и поверхности мяса. Присутствие специфических бактерий в микробном сообществе может иметь как положительное, так и отрицательное влияние на безопасность и полезность производимого мяса. На срок хранения как свежих, так и переработанных мясных продуктов сильно влияет распространение отдельных видов бактерий в микробиоме мяса в условиях окружающей среды, что может привести к нежелательным характеристикам продукта и неприятным впечатлениям для потребителя. Кроме того, важнейшим направлением деятельности мясной и птицеводческой промышленности является уничтожение специфических патогенов пищевого происхождения в микробиоме животных, растений и, в конечном итоге, в мясе, которое покупает потребитель.

Переработчики мяса и птицы имеют несколько инструментов для понимания контекста микробной экологии на протяжении всей цепочки поставок «от фермы до вилки». Культуральные методы используются в промышленности на протяжении десятилетий и остаются важным инструментом для получения хорошего понимания микробной нагрузки и присутствия отдельных патогенов. Однако достижения в области секвенирования нового поколения позволили понять микробных обитателей, составляющих микробиом, в такой степени, что культуральные методы ограничены.

Имея набор инструментов, полный инструментов, обработчики должны иметь возможность определить, какой инструмент лучше всего подходит для решения задаваемого исследовательского вопроса. Кроме того, переработчики мяса и птицы не имеют неограниченных исследовательских бюджетов, чтобы ответить на эти вопросы. Вдумчивый стратегический подход к общей цели тестирования может позволить переработчикам выбрать наиболее подходящий инструмент для работы. Цель этой статьи — предоставить широкий обзор двух геномных методов и потенциальных приложений для их использования переработчиками мяса и птицы.

Альберт Эйнштейн, как известно, сказал:"Если бы у меня был час на решение проблемы и от ее решения зависела бы моя жизнь, я бы потратил первые 55 минут на то, чтобы определить, какой вопрос задать… ведь как только я узнаю правильный вопрос, я смогу решить проблему менее чем за пять минут. "

Этот подход, безусловно, применим к переработчикам мяса и птицы, поскольку они сначала начинают определять, что необходимо изучить посредством тестирования. Этой части процесса обычно уделяется меньше всего внимания, когда переработчики сталкиваются с кризисом и ответы необходимы быстро. Наличие дисциплины, позволяющей четко определить вопрос исследования, позволяет переработчикам определить общую цель тестирования и поможет избежать ловушки «тестирования ради тестирования», которое часто является дорогостоящим и трудоемким как для завода, так и для лаборатории. , а иногда и не адекватно отвечает на вопрос. Как только исследовательский вопрос сформулирован, для ответа на этот вопрос можно применить эффективный дизайн теста и соответствующие методы.